2009年新年伊始，动议了十余年的燃油税费改革正式施行，改革对理顺交通税费关系、促进节能环保意义重大，尤其是对交通行业的发展具有深远的影响——实际上，改革涉及的财政交通工作才刚刚拉开序幕。
一是继续推动逐步有序取消政府还贷二级公路收费工作。在调研中笔者可以感受到，取消收费公路是老百姓的迫切愿望。取消政府还贷二级路不仅仅要算经济账，还要充分考虑其社会影响。考虑到各地实际情况差异较大，国家确定了“逐步有序”取消政府还贷二级公路收费的政策。接下来，中央有关部门应尽快指导地方确定停止收费时间，锁定债务和收费里程，并安排补助资金，尽快将政府还贷二级公路“还路于民”。
二是结合改革深入研究公路建设养护问题。燃油税费改革改变了交通运输行业的资金筹集、管理模式，也给财政交通工作带来了巨大的挑战。如何摸清公路建设的历史债务情况，避免因交通建设资金链断裂引发中国的“次贷危机”，今后公路建设的融资平台如何搭建，都是迫切需要研究的问题。尤其是近年来，农村公路养护问题虽日益引起国家的重视，但养护资金来源一直没有得到落实。2005年，国务院办公厅印发了《农村公路管理养护体制改革方案》，明确了农村公路管理养护的责任主体，也规定了养护资金来源和标准。但实际上在燃油税费改革前，没有专门的机构和人员对非列养的村道进行管理，农村公路缺乏固定的养护资金来源。实施燃油税费改革后，一方面应着手理顺预算管理体制，调动市县财政部门的积极性；另一方面对中央转移支付资金的使用应提出具体要求，落实有关规定，切实将农村公路养护工作落到实处。
三是应对油价上涨，早作预案。此次燃油税费改革把握住了千载难逢的机遇，即国际原油价格大幅下跌形成的国内成品油降价空间。从调研中了解到，由于油价总体上的下降，减小了此次改革对经济运行和人民生活的影响，也相应降低了改革的阻力。然而，居安当思危，若经济形势好转，油价重新高企，如何保障交通基础设施（尤其是公路）的养护资金来源，应早作预案。从国外已有的经验来看，由于节能技术的广泛应用，车辆行驶里程和燃油消耗成非线性增长，导致燃油税收入上升缓慢，为公路建设和养护带来较大资金压力。为此，很多国家都在积极研究开征新的税种，以弥补公路建设资金缺口。如：美国在开征燃油税之外，还征收重量里程税、重型轮胎税、油老虎税等，甚至尝试重新发展收费公路。可见，只有依靠多税种体系，才能为国家交通提供长期稳定的资金来源，同时对纳税人的行为进行调节，实现改革的长期目标。
燃油税费改革是一个系统工程，改革能否顺利实施，在相当程度上依赖于配套措施是否完善。近年来，财政改革的一系列实践和创新为燃油税费改革打下了良好的基础，如：粮食直补、农资综合补贴的顺利实施，建立了对相关用油群体的补贴渠道，使燃油税在生产环节征收能够得以实现；中央代理地方发债的政策设计，给公路建设融资开辟了新的渠道。在改革实施之后，仍有很多配套的政策需要继续完善，以保障改革的顺利推进。比如，对不属于公共交通服务范畴的出租车行业，在改革的过渡时期，可以采取政府给予油价补贴的方式，但从长远来看，应尽快建立油价联动机制，使成品油价的涨落能够在一定程度上体现在运价中，从而主要由最终消费者承担。此外，政府应着力于不断提高出租车公司的经营管理水平，合理确定其垄断利润，从而为城市出租车创造良好的经营环境